
<html>


<head>


<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">


</head>


<body>


Dear Slurm users,<br>


<br>


I wanted to discuss a bug with you, which has troubled me several times. I could not find a discussion about it through Google nor DDG, although it is mentioned


<a moz-do-not-send="true" href="https://github.com/snakemake/snakemake/issues/134#issuecomment-561185825">


here</a> in a Snakemake Issue.<br>


<br>


<br>


When scheduling the following file through sbatch:<br>


<br>


<font face="monospace">```<br>


#SBATCH --output=dir/slurm-out.log<br>


<br>


echo "Hello world"<br>


```<br>


</font><br>


If `dir/` does not exist, Slurm fails <b>silently</b> after queuing. 'Silently' is bold there, because this is unexpected behaviour to me.<br>


<br>


I understand that there is no output file to write an error message to, but it might be good to check the `--output` path during the scheduling, just like `--account` is checked.<br>


<br>


Does anybody know a workaround to be warned about the error?<br>


<br>


<br>


With kind regards,<br>


Dries Boers<br>


<font size="-1"><i>PhD candidate at Swedish University of Agricultural Sciences</i></font><br>


<p>---<br>


När du skickar e-post till SLU så innebär detta att SLU behandlar dina personuppgifter. För att läsa mer om hur detta går till, klicka


<a href="https://www.slu.se/om-slu/kontakta-slu/personuppgifter/">här </a><br>


E-mailing SLU will result in SLU processing your personal data. For more information on how this is done, click


<a href="https://www.slu.se/en/about-slu/contact-slu/personal-data/">here </a></p>


</body>


</html>