<div dir="ltr"><div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif">Please see below that salloc says unable to exec command, while srun is able to run that</div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif">[mahmood@rocks7 ~]$ salloc --nodelist=compute-0-4 -p RUBY -A y4 --mem=4G -c 4 --spankx11 /state/partition1/v190/Framework/bin/Linux64/runwb2<br>salloc: Granted job allocation 104<br>salloc: error: Unable to exec command "/state/partition1/v190/Framework/bin/Linux64/runwb2"<br>salloc: Relinquishing job allocation 104<br>[mahmood@rocks7 ~]$ srun --nodelist=compute-0-4 -p RUBY -A y4 --mem=4G -c 4 --spankx11 /state/partition1/v190/Framework/bin/Linux64/runwb2<br>^Csrun: interrupt (one more within 1 sec to abort)<br>srun: step:105.0 task 0: running<br>^Csrun: sending Ctrl-C to job 105.0<br>srun: Job step aborted: Waiting up to 62 seconds for job step to finish.<br>slurmstepd: error: *** STEP 105.0 ON compute-0-4 CANCELLED AT 2018-12-26T15:15:52 ***<br>[mahmood@rocks7 ~]$<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif">I intentionally pressed ^C for the srun to exit the job.</div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif"><br clear="all"></div><div><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><font face="tahoma,sans-serif">Regards,<br>Mahmood</font><br><br><br></div></div></div><br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Wed, Dec 26, 2018 at 11:44 PM Mahmood Naderan <<a href="mailto:mahmood.nt@gmail.com">mahmood.nt@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif">But the problem is that it doesn't find the file path. That is not related to slurm parameters AFAIK.</div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif"><br></div><div><div dir="ltr" class="gmail-m_5649384716699290462gmail_signature"><div dir="ltr"><font face="tahoma,sans-serif">Regards,<br>Mahmood</font><br><br><br></div></div></div><br></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Wed, Dec 26, 2018 at 11:37 PM Ing. Gonzalo E. Arroyo <<a href="mailto:garroyo@ifimar-conicet.gob.ar" target="_blank">garroyo@ifimar-conicet.gob.ar</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div dir="ltr">You should try starting with small amount of parameters, for example if I have my IFIMAR partition and I need 2 cores in 1 node: salloc -N1 -n2 --partition IFIMAR <br clear="all"><div><div dir="ltr" class="gmail-m_5649384716699290462gmail-m_676880454876588675gmail_signature"><div dir="ltr"><br><div><b><font size="2">Ing. Gonzalo E. Arroyo - CPA Profesional</font></b></div><div><font size="6">IFIMAR - CONICET</font></div><div><i><a href="http://www.ifimar-conicet.gob.ar" target="_blank">www.ifimar-conicet.gob.ar</a></i></div><div><br></div><div><b style="font-size:x-small">Este mensaje es confidencial. Puede contener información amparada por el secreto comercial. Si usted ha recibido este e-mail por error, deberá eliminarlo de su sistema. No deberá copiar el mensaje ni divulgar su contenido a ninguna persona. Muchas gracias.</b><br style="font-size:x-small"><span style="font-size:x-small">This message is confidential. It may also contain information that is privileged or not authorized to be disclosed. If you have received it by mistake, delete it from your system. You should not copy the messsage nor disclose its contents to anyone. Thanks.</span><br></div></div></div></div><br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">El mié., 26 dic. 2018 a las 16:37, Mahmood Naderan (<<a href="mailto:mahmood.nt@gmail.com" target="_blank">mahmood.nt@gmail.com</a>>) escribió:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif">Hi,</div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif">Although the command exists on the node, salloc says there is no such file. Please see below</div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif">[mahmood@rocks7 ~]$ cat workbench.sh<br>#!/bin/bash<br>#SBATCH --nodes=1<br>#SBATCH --cores=4<br>#SBATCH --mem=4G<br>#SBATCH --partition=RUBY<br>#SBATCH --account=y4<br>unset SLURM_GTIDS<br>/state/partition1/v190/Framework/bin/Linux64/runwb2<br><br>[mahmood@rocks7 ~]$ rocks run host compute-0-4 "ls -l /state/partition1v190/Framework/bin/Linux64/runwb2"<br>Warning: untrusted X11 forwarding setup failed: xauth key data not generated<br>-rwxr-xr-x 1 root root 8232 Nov 30  2017 /state/partition1/v190/Framework/bin/Linux64/runwb2<br>[mahmood@rocks7 ~]$ salloc --nodelist=compute-0-4 --spankx11 ./workbench.sh<br>salloc: Granted job allocation 95<br>./workbench.sh: line 8: /state/partition1/v190/Framework/bin/Linux64/runwb2: No such file or directory<br>salloc: Relinquishing job allocation 95<br><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif">Any idea about that?<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif"><br></div><div><div dir="ltr" class="gmail-m_5649384716699290462gmail-m_676880454876588675gmail-m_2138888440883873495gmail_signature"><div dir="ltr"><font face="tahoma,sans-serif">Regards,<br>Mahmood</font><br><br><br></div></div></div></div></div>
</blockquote></div>
</blockquote></div>
</blockquote></div>