<div dir="ltr"><div dir="ltr">Hi Alfredo,<div><br></div><div>You can have a look at using <a href="https://github.com/eth-cscs/GREASY">https://github.com/eth-cscs/GREASY</a> . It was developed before array-jobs were supported in slurm and it will do exactly what you want.</div><div><br></div><div>Regards,<br>Carlos</div></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Wed, Dec 19, 2018 at 3:33 PM Alfredo Quevedo <<a href="mailto:maquevedo.unc@gmail.com">maquevedo.unc@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">thank you Michael for the feedback, my scenario is the following: I want <br>
to run a job array of (lets say) 30 jobs. So I setted the slurm input as <br>
follows:<br>
<br>
#SBATCH --array=1-104%30<br>
#SBATCH --ntasks=1<br>
<br>
however only 4 jobs within the array are launched at a time due to the <br>
allowed max number of jobs as setted in the slurm configuration (4). As <br>
a workaround to the issued, the sysadmin suggested me to request the <br>
resources, and afterwards distribute the resources asigned into a <br>
multiple set of single CPU task. I believe that with the solution you <br>
mentioned only 30 (out of the 104) jobs will be finished?<br>
<br>
thanks<br>
<br>
Alfredo<br>
<br>
<br>
El 19/12/2018 a las 11:15, Renfro, Michael escribió:<br>
> Literal job arrays are built into Slurm: <a href="https://slurm.schedmd.com/job_array.html" rel="noreferrer" target="_blank">https://slurm.schedmd.com/job_array.html</a><br>
><br>
> Alternatively, if you wanted to allocate a set of CPUs for a parallel task, and then run a set of single-CPU tasks in the same job, something like:<br>
><br>
>    #!/bin/bash<br>
>    #SBATCH --ntasks=30<br>
>    srun --ntasks=${SLURM_NTASKS} hostname<br>
><br>
> is one way of doing it. If that’s not what you’re looking for, some other details would be needed.<br>
><br>
<br>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature">--<br>Carles Fenoy<br></div>