<div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr">Hi All, I have recently set up a slurm cluster with my servers and I'm running into an issue while submitting GPU jobs. It has something to to with gres configurations, but I just can't seem to figure out what is wrong. Non GPU jobs run fine.<div><br></div><div>The error is as follows:</div><div>sbatch: error: Batch job submission failed: Invalid Trackable RESource (TRES) specification  after submitting a batch job.</div><div><br></div><div>My batch job is as follows:</div><div><div>#!/bin/bash</div><div>#SBATCH --partition=tiger_1   # partition name<br></div><div>#SBATCH --gres=gpu:k20:1<br></div><div>#SBATCH --gres-flags=enforce-binding</div><div>#SBATCH --time=0:20:00  # wall clock limit<br></div><div>#SBATCH --output=gpu-%J.txt</div><div>#SBATCH --account=lnicotra<br></div><div>module load cuda<br></div><div>python gpu1<br></div><div><br></div><div>Where gpu1 is a GPU test script that runs correctly while invoked via python. Tiger_1 partition has servers with GPUs, with a mix of 1080GTX and K20 as specified in slurm.conf</div><div><br></div><div>I have defined GRES resources in the slurm.conf file:</div><div><div># GPU GRES</div><div>GresTypes=gpu</div><div>NodeName=tiger[01,05,10,15,20] Gres=gpu:1080gtx:2</div><div>NodeName=tiger[02-04,06-09,11-14,16-19,21-22] Gres=gpu:k20:2</div></div><div><br></div><div>And have a local gres.conf on the servers containing GPUs...</div><div><div>lnicotra@tiger11 ~# cat /etc/slurm/gres.conf</div><div># GPU Definitions</div><div># NodeName=tiger[02-04,06-09,11-14,16-19,21-22] Name=gpu Type=K20 File=/dev/nvidia[0-1]</div><div>Name=gpu Type=K20 File=/dev/nvidia[0-1] Cores=0,1</div></div><div><br></div><div>and a similar one for the 1080GTX</div><div><div># GPU Definitions</div><div># NodeName=tiger[01,05,10,15,20] Name=gpu Type=1080GTX File=/dev/nvidia[0-1]</div><div>Name=gpu Type=1080GTX File=/dev/nvidia[0-1] Cores=0,1</div></div><div><br></div><div>The account manager seems to know about the GPUs...</div><div><div>lnicotra@tiger11 ~# sacctmgr show tres</div><div>    Type            Name     ID</div><div>-------- --------------- ------</div><div>     cpu                      1</div><div>     mem                      2</div><div>  energy                      3</div><div>    node                      4</div><div> billing                      5</div><div>      fs            disk      6</div><div>    vmem                      7</div><div>   pages                      8</div><div>    gres             gpu   1001</div><div>    gres         gpu:k20   1002</div><div>    gres     gpu:1080gtx   1003</div></div><div><br></div><div>Can anyone point out what am I missing?</div><div><br></div><div>Thanks!</div><div>Lou</div><div><br></div><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><p style="margin-bottom:0.0001pt;line-height:normal;background-image:initial;background-position:initial;background-repeat:initial"><b><span style="font-size:9.5pt;font-family:Arial,sans-serif;color:rgb(111,168,220)">Lou Nicotra</span></b><span style="font-size:9.5pt;font-family:Arial,sans-serif"></span></p>

<p style="margin-bottom:0.0001pt;line-height:normal;background-image:initial;background-position:initial;background-repeat:initial"><span style="font-size:9.5pt;font-family:Arial,sans-serif;color:rgb(102,102,102)">IT Systems Engineer -
SLT</span><span style="font-size:9.5pt;font-family:Arial,sans-serif"></span></p>

<p style="margin-bottom:0.0001pt;line-height:normal;background-image:initial;background-position:initial;background-repeat:initial"><span style="font-size:9.5pt;font-family:Arial,sans-serif;color:rgb(102,102,102)">Interactions LLC</span></p>

<p style="margin-bottom:0.0001pt;line-height:normal;background-image:initial;background-position:initial;background-repeat:initial"><span style="font-size:9.5pt;font-family:Arial,sans-serif">o:  </span><span style="font-size:9.5pt;font-family:Arial,sans-serif;color:rgb(102,102,102)"><a href="tel:781-405-5114" target="_blank"><span style="color:rgb(17,85,204)">908-673-1833</span></a></span><span style="font-size:9.5pt;font-family:Arial,sans-serif"></span></p>

<p style="margin-bottom:0.0001pt;line-height:normal;background-image:initial;background-position:initial;background-repeat:initial"><span style="font-size:9.5pt;font-family:Arial,sans-serif;color:rgb(102,102,102)">m: <a href="tel:781-405-5114" target="_blank"><span style="color:rgb(17,85,204)">908-451-6983</span></a></span><span style="font-size:9.5pt;font-family:Arial,sans-serif"></span></p>

<p style="margin-bottom:0.0001pt;line-height:normal;background-image:initial;background-position:initial;background-repeat:initial"><u><span style="font-size:9.5pt;font-family:Arial,sans-serif;color:rgb(17,85,204)"><a href="mailto:lnicotra@interactions.com" target="_blank">lnicotra@interactions.com</a></span></u><span style="font-size:9.5pt;font-family:Arial,sans-serif"></span></p>

<span style="font-size:9.5pt;line-height:107%;font-family:Arial,sans-serif;color:rgb(102,102,102)"><a href="http://www.interactions.com/" target="_blank"><span style="color:rgb(17,85,204)">www.interactions.com</span></a></span><br></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>

<br>
<font face="Times New Roman" size="3">

</font><p style="margin:0in 0in 8pt"><font face="Calibri" size="3">******************************<wbr>******************************<wbr>*******************</font></p><font face="Times New Roman" size="3">

</font><p style="margin:0in 0in 8pt"><font face="Calibri" size="3">This e-mail and any of its attachments may contain
Interactions LLC proprietary information, which is privileged,
confidential, or subject to copyright belonging to the Interactions
LLC. This e-mail is intended solely for the use of the individual or
entity to which it is addressed. If you are not the intended recipient of this
e-mail, you are hereby notified that any dissemination, distribution, copying,
or action taken in relation to the contents of and attachments to this e-mail
is strictly prohibited and may be unlawful. If you have received this e-mail in
error, please notify the sender immediately and permanently delete the original
and any copy of this e-mail and any printout. Thank You.  </font></p><font face="Times New Roman" size="3">

</font><p style="margin:0in 0in 8pt"><font face="Calibri"><font size="3">******************************<wbr>******************************<wbr>*******************<span>  </span></font></font></p><font face="Times New Roman" size="3">

</font>