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<body dir="ltr" style="font-size:14pt;color:#000000;background-color:#FFFFFF;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">

<p>Hi there,<br>

</p>

<p><br>

</p>

<p>I run a small SLURM cluster that serves both bigmem applications as well as parallelizing data reduction pipelines.<br>

</p>

<p><br>

</p>

<p>I'm interested in allowing users to write interim files to shared memory in /dev/shm/$USER/$SLURM_JOBID but I don't know how to tell slurm to include those files in the given job's memory consumption, killing said job if its application memory + shared

 memory use exceeds the allocated value.<br>

</p>

<p><br>

</p>

<p>Can anyone advise how I would go about doing this?<br>

</p>

<p><br>

</p>

<p>Many thanks,<br>

</p>

<p>   Sam<br>

</p>

<p><br>

</p>

<div id="Signature">

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<hr style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; text-align:center">

<div class="PlainText">

<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; text-align:right"><span style="font-size:large">Sam Hawarden</span></div>

<font size="4">

<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; text-align:right">Assistant Research Fellow</div>

<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; text-align:right">Pathology Department</div>

<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; text-align:right">Dunedin School of Medicine</div>

<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; text-align:right">sam.hawarden(at)otago.ac.nz</div>

 </font></div>

</div>

</div>

</div>

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