<div dir="ltr">Just for completion. I can recommend using <a href="https://singularity.lbl.gov/" target="_blank">singularity</a> /docker containers. You can copy them to the worker nodes during sbatch. In the long run it eases up a lot.<div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="m_-3666776442987429644gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><span style="font-size:small;font-family:arial">Viele Grüße / kind regards</span><br style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px">Georg</span><br style="font-size:12.8px"><br style="font-size:12.8px">2018-05-10 17:48 GMT+02:00 Simon Flood <span dir="ltr"><<a href="mailto:S.M.Flood@uis.cam.ac.uk" target="_blank">S.M.Flood@uis.cam.ac.uk</a>></span>:<br></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><span>On 10/05/18 16:35, Eric F. Alemany wrote:<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
I know this might sounds as a very basic question: where in the cluster should I install Python and R?<br>
Headnode?<br>
Execute nodes ?<br>
<br>
And is there a particular directory (path) I need to install Python and R.<br>
<br>
Background:<br>
SLURM on Ubuntu 18.04<br>
1 headnode<br>
4 execute nodes<br>
NFS shared drive among all nodes.<br>
<br>
Thank you all for your help.<br>
</blockquote>
<br></span>
(N)Either - install them in directories on the NFS shared drive so that all nodes have access to them. You'll then need to either manually set PATH and other environment variables or use module files to manage these.<br>
<br>
Presumably all nodes, head and execute, are running the same version of the same OS otherwise that could cause a problem with libraries, etc.<br>
<br>
HTH,<br>
Simon<span class="m_-3666776442987429644HOEnZb"><font color="#888888"><br>
-- <br>
Simon Flood<br>
HPC System Administrator<br>
University of Cambridge Information Services<br>
United Kingdom<br>
<br>
</font></span></blockquote></div><br></div></div>