<div dir="ltr"><div><div><div><div><div><div>Assuming you plan for users to use R in jobs, it will need to be accessible to the execute/compute nodes.<br></div>I would usually suggest on a shared drive.   Although it should be OK if locally installed on each compute <br></div>node (probably want at same exact path and with same R packages installed).  Presumably you would<br></div>also want it available on the login nodes (users tend to like to see what software is installed, etc).  I do not believe<br></div>R is needed on the headnode (the one running the scheduler) unless that also serves as the login node.<br><br></div>The situation for python would be the same, except that I do not recall if the slurm daemons or utilities want<br></div>python (if so, you would need it on the head node, but would not need science related packages like numpy/scipy).<br><br><div><div><div><div><div><br><br></div></div></div></div></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, May 10, 2018 at 11:35 AM, Eric F. Alemany <span dir="ltr"><<a href="mailto:ealemany@stanford.edu" target="_blank">ealemany@stanford.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">



<div dir="auto">
<div>Hi All,</div>
<div id="m_-768708383162705272AppleMailSignature"><br>
</div>
<div id="m_-768708383162705272AppleMailSignature">I know this might sounds as a very basic question: where in the cluster should I install Python and R?</div>
<div id="m_-768708383162705272AppleMailSignature">Headnode?</div>
<div id="m_-768708383162705272AppleMailSignature">Execute nodes ?</div>
<div id="m_-768708383162705272AppleMailSignature"><br>
</div>
<div id="m_-768708383162705272AppleMailSignature">And is there a particular directory (path) I need to install Python and R.<br>
<br>
Background:</div>
<div id="m_-768708383162705272AppleMailSignature">SLURM on Ubuntu 18.04</div>
<div id="m_-768708383162705272AppleMailSignature">1 headnode </div>
<div id="m_-768708383162705272AppleMailSignature">4 execute nodes</div>
<div id="m_-768708383162705272AppleMailSignature">NFS shared drive among all nodes.</div>
<div id="m_-768708383162705272AppleMailSignature"><br>
</div>
<div id="m_-768708383162705272AppleMailSignature">Thank you all for your help.</div>
<div id="m_-768708383162705272AppleMailSignature"><br>
</div>
<div id="m_-768708383162705272AppleMailSignature">Best,</div>
<div id="m_-768708383162705272AppleMailSignature">Eric</div>
<div id="m_-768708383162705272AppleMailSignature"><br>
<div style="direction:inherit"><span style="text-align:-webkit-auto;background-color:rgba(255,255,255,0)">._____________________________<wbr>______________________________<wbr>______________________________<wbr>____________</span></div>
<div style="text-align:-webkit-auto;word-wrap:break-word">
<div><span style="background-color:rgba(255,255,255,0)"><br>
</span></div>
<span style="background-color:rgba(255,255,255,0)"><b>
<div><b style="text-align:-webkit-auto">Eric F.  Alemany</b></div>
</b>
<div><i style="text-align:-webkit-auto">System Administrator for Research</i></div>
</span>
<div><span style="background-color:rgba(255,255,255,0)"><br>
</span></div>
<div><span style="text-align:-webkit-auto;background-color:rgba(255,255,255,0)">Division of Radiation & Cancer  Biology</span></div>
<div><span style="text-align:-webkit-auto;background-color:rgba(255,255,255,0)">Department of Radiation Oncology</span></div>
<div><span style="background-color:rgba(255,255,255,0)"><br>
</span></div>
<div><span style="text-align:-webkit-auto;background-color:rgba(255,255,255,0)">Stanford University School of Medicine</span></div>
<div><span style="text-align:-webkit-auto;background-color:rgba(255,255,255,0)">Stanford, California 94305</span></div>
<div><span style="background-color:rgba(255,255,255,0)"><br>
</span></div>
<div><span style="background-color:rgba(255,255,255,0)"><font style="text-align:-webkit-auto">Tel:</font><a href="tel:1-650-498-7969" dir="ltr" target="_blank">1-650-498-7969</a><font style="text-align:-webkit-auto"> 
 No Texting</font></span></div>
<div><span style="background-color:rgba(255,255,255,0)"><font style="text-align:-webkit-auto">Fax:</font><a href="tel:1-650-723-7382" dir="ltr" target="_blank">1-650-723-7382</a></span></div>
</div>
</div>
</div>

</blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">Tom Payerle <br>DIT-ACIGS/Mid-Atlantic Crossroads        <a href="mailto:payerle@umd.edu" target="_blank">payerle@umd.edu</a><br></div><div>5825 University Research Park               (301) 405-6135<br></div><div dir="ltr">University of Maryland<br>College Park, MD 20740-3831<br></div></div></div></div></div></div>
</div>